铭研生物拥有专业的技术团队,丰富的生物信息学分析经验,依托于亚洲最大的质谱检测与分析中心,采用最先进的Orbitrap Fusion Lumos质谱仪,建立了基于Bioinformatics Assisted De novo Sequencing(BADS)技术的全新一代抗体测序平台。我们的BADS平台运用最新计算程序对抗体肽段序列进行解析,利用其独特的内部数据挖掘工具保证从上万条MS/MS光谱数据中提取目标抗体序列,从而实现对抗体氨基酸序列的精准解读。同时,铭研生物拥有自建的高通量表达验证平台,能够对已测得的抗体序列进行高通量表达验证,从而保证交付抗体的活性。

服务内容

客户提供 质谱测序 抗体表达 交付 周期
单克隆抗体(>0.1mg,纯度>95%)
  • 多酶消化
  • Orbitrap LC-MS/MS
  • 质谱数据分析及序列拼接
  • 基因合成&克隆
  • 瞬时表达&纯化
  • 纯度>90%
  • 内毒素<1EU/ug
  • 抗体测序报告
  • 1mg重组抗体
  • 测序3周
  • 表达抗体3周

服务优势

  1. 自主研发的BADS技术,确保100%全序列覆盖
  2. 自建的高通量重组抗体表达验证平台,保证交付抗体的活性
  3. 生物信息学辅助分析,确保交付序列信息的完整性和准确性
  4. 提供不同物种、同种型、同种异型的全长抗体、重链和轻链抗体的测序

服务特色

  1. 保证交付抗体的活性,不成功不收费
  2. 测序周期短,最快2周内完成
  3. 我们可为您提供一次抗体测序结果的免费分析服务
抗体氨基酸测序服务优势

抗体测序流程

抗体测序实验流程

BADS抗体测序平台介绍

运用BADS技术对V、J、C片段测序

虽然抗体的V,J和C区基因片段可在公共数据库(如NCBI)中获得,但是在抗体亲和力成熟过程中,B细胞会引入超突变以优化亲和力。铭研的作图算法具有高容错能力,能可靠地将突变肽段与相应的种系匹配。由于肽段数量众多,我们可以获得抗体中每个肽键的序列信息。 通常,每个氨基酸(AA)位置会生成20-70个不同的MS/MS光谱。因此,即使最困难的脯氨酸和精氨酸富集的肽段序列也可以解析。

抗体CDR3区测序

运用BADS技术CDR3区测序

重链CDR3是抗体CDR区最多变的区域,几乎很难从已知抗体中找到信息。重链CDR3由D基因编码,但D基因大部分区域由于受到核酸酶及末端转移酶等重组酶的作用而发生基因重排,导致抗体重链CDR区在数据库中无法进行同源比对。

铭研通过5-8种蛋白酶进行酶切,产生多种互相重叠的肽段,以测得较长的未知氨基酸序列。并且利用不同酶切肽段间的互补性,可以实现轻重链100%全序列的拼接。

等重氨基酸的区分

等重氨基酸是单个氨基酸或多个氨基酸分子量之和等于其他氨基酸或氨基酸组合。仅通过质谱较难区分。我们基于抗体库和酶切位点可对其进行高效区分,例如:L与I;W与GE、AD、SV;R与GV;N与GG;Q与GA等。

标记抗体的测序

我们独特的BADS技术可以减少生物素,FITC等标记对测序的影响,并且可通过高通量表达筛选平台对抗体序列进行最后把关。

相关资料