密码子适应指数(CAI)分析

密码子适应指数(CAI)是指编码区同义密码子与最佳密码子使用频率的相符程度,取值在0~1之间。CAI可以用来评估外源基因在宿主内的表达水平,CAI越高,则外源基因在宿主内的表达水平越高。

密码子适应指数分析工具的工作原理为:以高表达基因的序列为参考(参考序列),评估目的基因与参考序列的密码子使用频率相符程度。

如果分析得到的CAI很低,则基因在宿主细胞内的表达水平低,需要对目标序列进行密码子优化

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